掌握舰船的基础控制是指挥舰队的第一步。你需要通过下达指令来操控舰船，大部分指令都会消耗策略值。最基本的指令是行动，它允许你的舰队攻击选定的敌方舰队或建筑。进行资源采集时，你需要在地图的资源带上点击开采并建立计划圈，工程舰便会前往作业。对于更复杂的行动，如集结盟友发起集体进攻，则需要通过发布集体指令来协调，这能让行动目标更清晰地展示给所有成员。善用增援指令可以快速将最多五艘舰船加入一支已外派的舰队，但这会统一调整整支舰队的巡航速度。移动时，如果计划圈内已有我方舰队或建筑建立了曲率锚点，后续舰队便能以更快的曲率速度航行，这是进行长途奔袭或快速调防的关键。
在战斗操作层面，实时的决策与细节管理至关重要。你需要根据战场形势灵活分配舰船的能源，例如在被围攻时优先保障防护盾能量，在追击时侧重引擎加速。预判敌方舰队动向可以有效规避攻击或创造反击机会。战斗中，合理利用包夹战术能直接攻击敌方中后排舰队，因此分兵操作和高机动舰队的绕后至关重要。面对拥有维修艇的敌方编队，优先集火摧毁这些后勤单位能避免战斗拖入消耗战。时刻关注战报，分析敌我舰船损毁原因和受到的伤害类型，以便下次针对性调整护甲或闪避属性。当遭遇强敌时，通过增援指令临时调遣防御型舰船支援前线，是稳住阵线的有效手段。
舰船的长期操作与养成体现在技术值加点和舰队编成上。每艘舰船都有多个系统可供强化，加点方向应与其定位严格匹配。对于负责输出的舰船，若其武器单发伤害高但攻击间隔长，应优先降低冷却时间；若单发伤害低但射速快，则优先提升伤害。防御型舰船自然要优先强化装甲系统，提升护甲和结构值。而像工程舰这类后勤单位，则应全力强化其仓库容量和开采效率。在舰队编组时，要有清晰的功能性配队思路，例如组建以高攻城属性、高移速舰船为主的拆家队，用以骚扰敌方后方设施。将防空能力突出的舰船编入主力舰队，可以专门应对敌方的航母舰载机。理解每艘船的设计用途并将其部署在合适的位置，是发挥舰队最大潜能的操作核心。
